Workshop 1 · IA & bioinformatique

Les micro-mondes à la lumière du séquençage nanopore et de l'intelligence artificielle

Réalisez, sans écrire une ligne de code, une analyse complète de données de séquençage : de la lecture brute de l'ADN à l'hypothèse de fonction d'une protéine inconnue.

Réserver ma place — 300 € Faire financer ma place

Paiement possible en 3 fois (3 × 100 €), jusqu'au 31 octobre. Comment faire

Mercredi 9 décembre 2026 12h30 – 16h00 Auditorium du Crédit Agricole · Le Lamentin 15 places

Ce que vous saurez faire en sortant

Expliquer le principe du séquençage nanopore et le rôle des réseaux de neurones dans la production des séquences d'ADN
Exécuter une chaîne d'analyse complète dans Galaxy, sans écrire de code
Contrôler la qualité de lectures nanopore et justifier ses seuils de filtrage
Interpréter la composition taxonomique d'échantillons environnementaux et leurs indices de diversité
Annoter un génome bactérien et formuler, avec des outils d'IA, une hypothèse de fonction pour une protéine inconnue
Évaluer le degré de confiance à accorder aux résultats des outils d'IA

Au programme

1
Séquençage nanopore et prise en main
- La biodiversité microbienne : ce que la culture ne permet pas de voir
- Principe du séquençage nanopore : un réseau de neurones traduit le signal électrique en séquence d'ADN
- Prise en main de la plateforme d'analyse en ligne Galaxy
2
Analyser une communauté microbienne du sol
- Jeu de données réel : rhizosphère et sol non rhizosphérique, en surface et en profondeur
- Contrôle qualité et filtrage des lectures nanopore
- Classification taxonomique, visualisation des communautés, indices de diversité alpha et bêta
3
Du génome à la fonction : l'apport de l'IA
- Annotation d'un génome bactérien complet séquencé au MinION
- Identification des protéines de fonction inconnue, gènes de virulence et de résistance aux antibiotiques
- Prédiction de structure et de localisation par des modèles de langage protéique
4
Regard critique et bilan
- Interroger un assistant conversationnel sur ses propres résultats, et vérifier ses réponses
- Concevoir un plan d'expérience statistiquement valide
- Échanges sur les projets de recherche des participants

Votre intervenant

Pr Antony T. Vincent

Canada · Québec

Professeur à l'Université Laval (Québec, Canada) et chercheur à l'Institut de biologie intégrative et des systèmes (IBIS).

Workshop 1 : IA et bio-informatique

24 s · En français, sous-titréAvec le Pr Antony T. Vincent, mercredi 9 décembre.

Est-ce pour vous ?

Pour qui

Chercheurs, enseignants-chercheurs et techniciens en écologie, biologie ou sciences de l'environnement
Étudiants de ces disciplines
Toute personne qui souhaite découvrir l'analyse de données de séquençage appliquée à la biodiversité microbienne

Prérequis

Aucune connaissance préalable en bio-informatique ni en programmation
Des notions de base en biologie (ADN, gène, bactérie)
Un ordinateur portable, et un compte gratuit créé sur la plateforme Galaxy avant la séance (lien communiqué à l'inscription)

Méthode

Apports théoriques courts, illustrés par des démonstrations
Travaux pratiques guidés pas à pas, chacun sur sa propre machine
Étude de cas sur des données réelles et discussion critique collective

Comment régler votre place

En une fois

300 € par workshop, réglés en ligne par carte bancaire sur la billetterie de l'association. Votre billet vous est envoyé par e-mail.

Réserver en ligne (nouvelle fenêtre, site HelloAsso)

En 3 fois : 3 × 100 €

Trois versements par carte bancaire : 100 € à la commande, puis le 1er novembre et le 1er décembre. Votre billet vous est envoyé dès le 3e versement. Ouvert jusqu'au 31 octobre.

Payer en 3 fois (nouvelle fenêtre, site HelloAsso)

Mon employeur ou mon OPCO finance

Les workshops sont dispensés par l'ESEP-M, organisme de formation certifié Qualiopi : votre employeur ou votre OPCO peut les prendre en charge. Demandez un devis et une convention de formation.

Demander un devis

secretariatesep@gmail.com

En pratique

Mercredi 9 décembre 2026
12h30 – 16h00
Auditorium du siège du Crédit Agricole
21 rue Case-Nègre, Place d'Armes, 97232 Le Lamentin, Martinique
15 places
Inscription obligatoire
300 €
Attestation de formation délivrée par l'ESEP-M

Faut-il un niveau particulier ?

Aucune connaissance préalable en bio-informatique ni en programmation · Des notions de base en biologie (ADN, gène, bactérie) · Un ordinateur portable, et un compte gratuit créé sur la plateforme Galaxy avant la séance (lien communiqué à l'inscription).

Combien de places ?

15 places, pour garder un vrai temps d'échange avec l'intervenant. L'inscription est obligatoire.

Puis-je payer en plusieurs fois ?

Oui, jusqu'au 31 octobre : 3 versements de 100 €, à la commande puis le 1er novembre et le 1er décembre. Votre billet vous est envoyé dès le 3e versement. Voir comment.

Puis-je faire payer le workshop par mon employeur ?

Oui : les workshops sont dispensés par l'ESEP-M, organisme de formation certifié Qualiopi. Écrivez-lui pour obtenir un devis et une convention de formation : secretariatesep@gmail.com.

Le colloque est-il compris ?

Les conférences et les sessions scientifiques sont gratuites, sur inscription : réservez aussi votre billet pour la journée du colloque, il se prend sur la même billetterie.

Puis-je suivre plusieurs workshops ?

Oui : les trois workshops ont lieu trois jours différents, du mercredi 9 au vendredi 11 décembre.